婴幼儿腹泻的原因可以分为感染性因素和非感染性因素。

感染性因素：

1、肠道内感染：可由病毒、细菌、真菌、寄生虫引起，以前两者多见，尤其是病毒，寒冷季节的小儿腹泻80%由病毒感染引起。其中轮状病毒是引起孩子秋季腹泻最常见的病毒，其他的可以有星状病毒，诺如病毒等。

2、细菌感染：致腹泻大肠杆菌、弯曲菌及其它包括真菌、寄生虫等也会导致腹泻。

3、肠道外感染：有时引起消化功能紊乱也可产生腹泻症状，即症状性腹泻。使用抗生素引起的腹泻常表现为慢性迁延性。

非感染性因素：

1、饮食护理不当：比如喂养不当、食物突然改变或婴儿有乳糖不耐受，摄入了含有过多乳糖的食物等，导致腹泻。

2、过敏性腹泻：比如食物过敏相关性肠病、小肠结肠炎、直肠结肠炎等。

3、气候因素：气候突然变化，腹部受寒受凉，使肠蠕动增加，或天气过热，消化液分泌减少或由于口渴饮奶过多等也可导致婴幼儿腹泻。