北京市普仁医院始建于1900年，是英国政府在北平创办的一所医院，隶属于英国基都教会，初名为普仁医院，后几经辗转，于1949年7月1日，中共北平市公共卫生局在现址上成立北京市立第四医院。1958年，该院归属于原崇文区卫生局更名为北京市第四医院。2000年9月5日，区机构编制委员会批复医院为北京市普仁医院。
如今，医院集医疗、教学、科研和预防等大健康理念为一体，是隶属于北京市东城区的二级甲等综合医院。是皖南医学院教学医院，承担着医学院的科研、临床和公共卫生教学实习任务，是北京市首批基本医疗保险和工伤医疗保险定点单位。 医院占地面积14313.93平方米,总建筑面积40282.78平方米（其中主院区建筑面积36679.1平方米、尼奥大厦康复院区建筑面积3219.77平方米）。承担主院区、尼奥大厦康复院区、白桥大街院区、幸福大街院区的医疗卫生工作。
医院人员编制数918人，编制床位数400张。设有内科、外科、骨科、神经内科、重症医学科、妇科、儿科、眼科、耳鼻咽喉科、口腔科、传染科、急诊医学科、康复医学科、麻醉科等21个临床科室；设有医学检验科、病理科、医学影像科、超声诊断科等8个医技科室；设有呼吸内科、消化内科、血液内科、内分泌、皮肤科、肿瘤科等29个临床专业。拥有“四三三”区级重点学科建设架构即四个专科：骨科、肿瘤科、神经内科、内分泌科；三个平台：急危重症救治平台、手术导管治疗平台、检验病理检测平台；三个中心：急诊急救中心、血液净化中心、综合康复中心。
全力打造的新兴重点专业有：消化内镜、泌尿碎石等专业。 医院秉承“精·诚·仁·和”的院训，贯彻落实新时期党的卫生与健康工作方针，以东城区“十四五”时期卫生健康事业发展规划为契机，围绕“一个目标、两个中心、三个服务”即以晋升三级综合医院为目标，以病人和职工为中心，完成好政府保障服务、公共卫生服务、医疗健康服务，向人民满意医院的目标不懈迈进。
