头部核磁共振检查的费用大概约500元左右，根据不同地区的经济发展水平不同，医院的等级不同，以及磁共振机器的型号不同，价格可能略有差别，一般情况下，公立三甲医院头部核磁共振检查的价格大概在500元左右。可能有些基层医院，价格可能稍微偏低一些。磁共振因其较高的分辨率，目前在临床当中普遍应用，尤其是检查一些脑血管疾病，如脑梗死，脑出血等。头部核磁共振对脑梗死的诊断，尤其是急性期脑梗死的诊断比颅脑CT更有优势。