白塞病目前不能完全治愈，通常使用药物治疗缓解患者的症状。经过积极正规的药物治疗，大部分患者的病情控制良好，可以不继续发展或者不引起相关并发症。白塞病药物治疗常用糖皮质激素，如泼尼松等，可以起到减轻缓解炎症反应的作用；免疫抑制剂，如环磷酰胺、环孢素等，适用于神经系统受累、血管病变、眼部病变的患者；秋水仙碱，可用于治疗眼和皮肤的病变；沙利度胺，可用于治疗口腔及生殖器的溃疡。